本发明实施例公开了数据库透明加密方法、装置、计算机设备及存储介质。所述方法包括：获取待写入的数据，以得到初始数据；初始化配置相关信息；判断所述初始数据是否是需要加密；若所述初始数据需要加密，则采用分片加密方式对所述初始数据进行加密，并将加密结果写入磁盘文件中；若所述初始数据不需要加密，则将所述初始数据写入磁盘文件中。通过实施本发明实施例的方法可实现在不停业务系统的情况下完成对数据库的初始化，并在数据不断查询和使用过程中，完成对于数据库中存储数据的加密，无需中断业务，也不会造成性能的损耗，初始化时间短。