本发明公开了一种利用药物知识和句法依存关系的药物相互作用关系抽取方法，涉及自然语言处理技术领域。生物医学文献的爆炸式增长产生了大量关于药物相互作用的信息，药物实体名称大多是特定领域的名词，大多数现有模型忽略了专业领域知识和语法信息的重要性。本发明可以充分利用药物知识来获得更广泛的药物实体表示，以便模型理解药物相互作用文本语义。另一方面，句法特征对于从长而复杂的句子中抽取药物相互作用关系是有价值的，本发明可以应用句法图神经网络来有效地捕捉句子的句法信息，有效解决了药物实体复杂难以理解和药物相互作用文本过长的问题。