本发明公开一种样本架的清空方法，包括：获取所述样本架调度系统内样本架的滞留信息；根据所述滞留信息和预设清空策略，获得样本架清空顺序和样本架清空路径；利用所述样本架清空路径和所述样本架清空顺序，对所述样本架调度系统进行样本架清空操作。本发明还公开一种样本架的清空装置、样本架调度系统以及存储介质。利用本发明的方法，不需要技术人员手动操作，大大节省了样本架清空的时间，从而提高了样本架清空效率。