本发明提供了一种航空嵌入式设备运行过程中软件敏捷升级的方法，包括：(1)在应用软件中建立三个标志：启动标志、上次正确标志和上一状态正确标志；(2)嵌入式设备应用运行过程中根据新接收到的应用软件修改所述启动标志；(3)嵌入式设备根据当前启动标志去启动加载升级后的应用；(4)若加载升级后的应用运行正确，则将上次正确标志更新到上一状态正确标志，将启动标志更新到上次正确标志。该方法使得航空电子设备具备应用运行中升级软件的能力和应用升级后自动直接执行设计后软件的能力，并且可以在升级后软件异常时自动回滚到上一状态软件，也为用户提供了手动选择运行原状态软件或升级后软件的能力。