本发明涉及有机酸生产处理技术领域，提供了一种膜法制备L‑赖氨酸的方法。本发明创新性地将双极膜电渗析技术应用到医药生产领域，将L‑赖氨酸盐酸盐进行脱氯纯化处理，通过电场力的作用，可以得到纯化的L‑赖氨酸溶液；并且本发明使用的电渗析系统为二隔室双极膜电渗析系统，在进行电渗析处理时，不会引入其他离子，从而实现清洁生产，不会产生其他废物，避免了对环境的影响，电渗析装置及离子交换膜无需再生，使用寿命长，L‑赖氨酸的收率高。进一步的，本发明在接收室中产生的盐酸溶液，可回用至前端工艺调节pH，从而实现料液的循环使用，无工业废水产生，环保压力小。