本发明公开了一种含气凝胶抗菌聚酯纤维的制备方法：将充分干燥的含有气凝胶的第N聚酯母粒、聚酯切片、抗菌聚酯母粒经注射机分别计量共混放入螺杆纺丝机中进行熔融；熔融后的熔体通过熔体管道分配到纺丝箱体，由箱体内计量泵进行精确计量，再由计量泵输送到喷丝组件形成熔体细丝；将熔体细丝环吹风冷却、卷绕、成型；将成型的纤维经牵伸、定型、卷曲、切断、打包，制得含气凝胶抗菌聚酯纤维；本发明制备的含气凝胶抗菌聚酯纤维兼具质轻、保暖和抑菌抗菌的效果，可通过混纺、针刺等形成复合布等，在服用、家纺、民用保温等领域具有潜在的应用价值。