本发明涉及船舶角度修正技术领域，具体地说，涉及一种船载角度跟踪补偿系统。包括角度传感模块、控制对比模块和伺服执行模块；其中：角度传感模块用于检测各个角度位移量及角加速度；控制对比模块用于自动校正补偿船舶摆动带来的偏差，通过控制系统计算各个轴的角度补偿量；伺服执行模块用于操控伺服执行机构执行补偿角度指令。本发明设计可以自动检测船舶在各个角度的位移量及角加速度；对角度位移情况进行计算，准确计算各轴线上偏移角度的补偿量；通过伺服执行机构执行相应动作来修正船舶摆动带来的角度偏差，利用伺服系统进行快速补偿，在X、Y、Z三个轴线上保证稳定性，有效解决船舶在海洋中的角度波动对船载设备精度造成影响的问题。