本申请提供了一种更换合成有机硅单体原料的方法以及系统，涉及有机硅单体技术领域，解决目前通过停车更换反应原料的方式，会使得单体合成周期变短，从而导致单体生产效率降低的技术问题。所述方法包括：在流化床反应器处于运行状态的情况下，将目标气体持续通入所述流化床反应器，所述目标气体为不与所述流化床反应器中的物料发生化学反应的气体；在所述目标气体持续通入预设时长后，将所述流化床反应器中的部分物料导出；向所述流化床反应器中持续通入氯甲烷气体，以及向所述流化床反应器中加入反应原料。