本实用新型公开了医疗系统感控行业的灭菌技术领域的一种生物安全型卡式蒸汽灭菌器，包括饱和蒸汽发生系统、灭菌盒、给排气及温度传感器组件、排水排气过滤系统、热空气烘干系统、压力安全控制组件及排水排气管路系统，本实用新型通过设计增加排水排气过滤系统，重新设计灭菌盒上盖、下盒以及密封圈密封结构，从而满足对传染性物质污染的器械进行快速灭菌，并将传染性物质在灭菌中形成的气溶胶通过PTFE生物过滤器截留于灭菌区域内并进行在线灭菌，避免可能的气溶胶感染，解决了目前卡式灭菌器均为非生物安全型的窘境，保护了相关消毒供应专业技术人员、医务工作者及相应环境中流动人员，大大提高了卡式灭菌器的使用安全性和应用范围。