本发明公开了一种船舶调载系统、方法及存储介质，其中系统包括监测单元、神经网络调载单元和执行单元。其中监测单元用于监测船舶的实时状态信息及货物装载进度。神经网络调载单元用于采用神经网络，根据货物装载进度信息及船舶的实时状态信息预测设定时延后的船舶状态，根据设定时延后的船舶状态计算调载方案。执行单元用于根据调载方案调节船舶的压载水分布和压载水总量。根据上述技术方案的船舶调载系统，通过对装载货物后的船舶状态进行预测，并根据船舶状态预测结果和船舶实时状态对船舶压载水进行调节，实现时延较长的货物装载过程中的船舶状态调节，保持货物装载过程中船舶与码头轨道齐平，提高货物装载效率和安全性。