本发明公开了一种基于自注意力的医疗影像分割方法，可以应用于医疗影像分割领域。本发明利用Unet作为基准模型，通过增加多尺度特征提取编码结构和语义特征增强结构的处理，实现了多尺度特征的提取能力和准确边缘语义信息的获取能力。网络模型主要分为编码器、语义特征增强模块、解码器共三个模块。本方案适用于医疗影像的病变区域分割问题，具备多尺度特征提取能力和准确边缘语义信息的获取能力，具体能够解决多尺寸病变区域分割难和病变区域无固定形状导致的分割边缘模糊的问题。