本发明公开了一种基于物理驱动神经网络的无人船动力辩识方法、系统，属于无人船动力学辨识技术领域，一种基于物理驱动神经网络的无人船动力辩识方法，操作流程如下：步骤1，准备无人船，并在无人船上安装测试工具，将无人船设备放入长江上进行直航、回转和z字形行驶路线，利用数据采集器获取无人船不同运动姿态的数据，并将数据上传到系统并保存；步骤2，利用高斯去噪法对步骤1获取的不同运动姿态的数据进行清洗、去噪，利用去噪后的数据建立无人船三自由度动力方程，作为无人船动力模型，本发明方法能够直接对动力学模型进行求解，无需对方程进行离散，从而将计算模式大大简化，缩短了计算时间，并且能够保证辨识结果的准确性。