本发明涉及一种柔性自动装配工作站，属于机械设备技术领域，包括工作台、机器人夹爪放置台和夹取机器人，所述工作台上放置有用于输送电机转子的自动送料机构、用于放置转子轴和模具的置料台、用于将转子轴装配到电机转子上的转子轴装配机构、用于放置销轴并将销轴装配到模具上的销轴装配机构以及控制机构，所述机器人夹爪放置台用于放置不同类型的机器人夹爪以便夹取机器人快速更换来抓取不同类型的零件，所述夹取机器人用于抓取电机转子并将电机转子放置到轴承装配机构上，和用于抓取转子轴并将转子轴放置到电机转子上，以及用于抓取模具，并将模具放置到销轴装配机构上。本发明可以实现柔性化、自动化装配。