本发明公开了基于多视图鲁棒表示的癌症亚型识别系统，包括：数据获取模块，用于获取多个待识别用户的多组学数据；视图特征提取模块，用于基于所有用户的多组学数据，得到若干个视图；鲁棒表示模块，用于构建每个视图的鲁棒表示和字典矩阵；相似图构建模块，用于基于每个视图的鲁棒表示，计算每个视图的相似图；融合模块，用于构建视图权重参数，并将各个视图的相似图进行加权融合，形成一致图；迭代更新模块，用于迭代更新每个视图的鲁棒表示、字典矩阵、相似图、视图权重参数和一致图，得到最优一致图；聚类模块，用于基于最优一致图，通过聚类将所有待识别用户划分到多种癌症亚型。充分利用了多视图之间的一致和互补信息来提高聚类性能。