本发明公开了一种基于无人机遥感及深度学习的小麦幼苗监测方法，方法：步骤1、训练深度学习网络得到小麦幼苗检测模型；步骤2、使用小麦幼苗分级数据集训练深度学习网络得到小麦幼苗分级模型；步骤3、在小麦田间选择一个矩形区域作为取样块，在矩形的顶点处插上标签作为标记点，计算取样块面积S；步骤4、使用无人机采集取样块图像，利用小麦幼苗检测模型检测图像中所有幼苗的位置；步骤5、统计取样块内的小麦幼苗数量N，计算得到幼苗密度P=N/S；步骤6、利用小麦幼苗分级模型对取样块标记框中的所有幼苗个体进行分级，计算第i级别的幼苗数量Ni与幼苗数量N的比例Ri。本发明通过深度学习网络的训练和先验框的优化可以实现复杂场景下小麦幼苗的检测，大大提高了小麦幼苗检测的准确性和可靠性。