本发明提供一种红外多谱段滤光片制备方法，包括制备两组以上不同光谱段的滤光片，滤光片上设有光谱通道对准标识，将滤光片放置在样品盒内，将吸片工装固定在贴片仪的载片基台上，吸片工装上设有真空吸附通道和与滤光片的对准标识对应的对准标识，移动贴片仪依次吸取滤光片移至载片基台上方，调整滤光片的位置使得滤光片上的对准标识与吸片工装上的对准标识位置一致并将滤光片放置在吸片工装上，启动真空通道吸附住滤光片，在滤光片之间的缝隙内填充胶之后固化。本发明提供的制备方法，能够提高多谱段滤光片间的光谱配准精度，滤光片间共面度好且工艺方法简单，制备的红外多谱段滤光片能够覆盖多种波谱段，且能够进行不同厚度、宽度的滤光片组合。