本发明实施例公开了一种热敏打印机的打印标记检测方法及系统，包括纸张学习和纸张检测的步骤，纸张学习过程通过滑动平均值滤波器对原始数据进行初步降噪，利用K‑Means方法与快速傅里叶变换方式对纸张采样数据进行聚类并对聚类结果进行评价与反馈，得到合格的标记阈值，从而消除因纸张、传感器、温度、光照、电压等不确定因素对标记检测造成的不利影响；在纸张检测过程中，利用学习过程得到的标记阈值判断当前是否处于标记位置，并记录当前采样值，在打印机处于空闲状态时利用记录的采样值再次进行纸张学习过程，从而消除因外界低频扰动造成的传感器测量值基线漂移问题。