本发明属于酵素加工领域，具体涉及一种海藻酵素粉及其制备方法，其制备方法包括以下步骤：S1、选用海藻原料进行剪切，加水后加入复合酶进行酶解，同时辅助于超声处理，得到海藻酶解液；所述复合酶包括Protamex酶、中性蛋白酶和纤维素酶；S2、将步骤S1中得到的海藻酶解液投入发酵罐中，先接种枯草芽孢杆菌，再接种酵母菌于发酵罐中进行发酵，发酵完成后过滤杂质，并进行真空干燥，得到海藻酵素初粉；S3、在步骤S2得到的海藻酵素初粉中加入表面活性剂，均匀混合后进行喷雾干燥，即得。本发明通过选用特定组分的复合酶经过酶解、发酵工艺后得到的产物在表面活性剂的相互作用下，有效去除海藻腥味，制得无腥味的、具有良好抗氧化能力的海藻酵素粉。