基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法
实质审查的生效
摘要
本发明公开了一种基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法，对于待预测的细胞系收集蛋白质数据和样本DNA序列，在样本DNA序列中确定4个关键位点及对应的CTCF motif数据，根据所有样本DNA序列的CTCF motif数据训练Word2Vec模型和Doc2Vec模型，对于每个样本DNA序列分别提取其序列特征和蛋白质特征，然后拼接得到该样本DNA序列的特征向量，将样本DNA序列的特征向量作为输入、将CTCF介导染色质环是否存在的样本标签作为期望输出，对构建的CTCF介导染色质环预测模型进行训练，当需要对待预测的细胞系某个DNA序列中两个位点之前是否存在CTCF介导染色质环进行预测时，采用相同方法得到特征向量，输入训练好的CTCF介导染色质环预测模型得到预测结果。本发明可有效提高CTCF介导染色质环的预测准确率。
基本信息
专利标题 ：
基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114550817A
申请号 ：
CN202210086044.5
公开（公告）日 ：
2022-05-27
申请日 ：
2022-01-25
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
罗静彭文钰于小娟林国亮颜培祺
申请人 ：
云南大学
申请人地址 ：
云南省昆明市翠湖北路2号
代理机构 ：
成都行之智信知识产权代理有限公司
代理人 ：
温利平
优先权 ：
CN202210086044.5
主分类号 ：
G16B20/30
IPC分类号 ：
G16B20/30 G16B30/10 G16B40/00 G16B40/10 G06F40/284 G06F40/30
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B20/00
特别适用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如基因型-表型关联的ICT
G16B20/30
结合位点或基序检测
法律状态
2022-06-14 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 20/30
申请日 : 20220125
申请日 : 20220125
2022-05-27 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
文件下载
暂无PDF文件可下载
