本申请公开了一种干扰网络扫描器的方法及系统，涉及网络攻击与防御技术领域，干扰网络扫描器的方法包括以下步骤：制备若干操作系统的应答数据包并保存，嗅探所有访问者并接收访问数据包。若访问数据包为正常的流量访问，响应于访问数据包返回SYN/ACK的应答数据包，完成三次握手后与访问者建立通信连接。若访问数据包为扫描包，则发送除本机以外任意操作系统的应答数据包返回给网络扫描器。有益效果在于当网络扫描器访问时，根据指定操作系统的回应方式自动响应特定的应答数据包，而网络扫描器的算法是固定不变的，对于特定的应答数据包会生成特定的指纹，以此让攻击者的网络扫描器误判本操作系统为指定的操作系统。