本申请公开了一种基于旁路干扰的扫描器对抗方法及系统，涉及网络攻击与防御技术领域，基于旁路干扰的扫描器对抗方法包括以下步骤：制备若干操作系统的应答数据包并保存，整理访问数据包生成访问数据，根据访问数据判断访问数据包是否是关键数据包，若是，对关键数据包进行检测，检测关键数据包是否具有网络扫描器的特征项，若是，则发送除本机以外任意操作系统的应答数据包返回给网络扫描器。有益效果在于当网络扫描器访问时，旁路监听系统根据指定操作系统的应答数据包构造虚假回包，以此让攻击者的网络扫描器误判本操作系统为指定的操作系统。无需修改内核参数或重新编译内核，不容易造成系统崩溃的操作且实现起来简单。