一种面向流域汇水区域的磷排放污染负荷预测方法，涉及市政工程、环境工程、环境系统模拟预测技术与计算机技术交叉领域。本发明是为了解决目前的磷排放污染负荷预测方法还存在无法兼顾操作简单和科学准确的预测结果的问题。本发明所述包括：利用国控断面数据和DEM数据将研究流域划分为多个汇水区域；利用POI数据对研究流域所在区域中的城市区域进行土地类型划分获得划分好功能区的城市区域；按照磷排放的污染源类型，分别预测各类型的污染排放磷负荷；获得的每个汇水区域中获得分配好的每个汇水区域的每种磷负荷；将所有汇水区域的磷负荷汇总获取研究流域的总磷负荷。本发明用于预测流域的磷排放污染负荷。