本发明属于疾病传播分析技术领域，涉及一种基于图表达技术的流行病传播分析方法、系统和可读介质，包括：基于流行病传播数据和网络结构图模拟离散时间量子漫步，通过量子漫步挖掘网络结构图中各节点相似度；根据节点相似度，生成每个目标节点的中间表达；通过中间表达对神经网络模型进行训练，获得节点的表达向量；基于已知节点的表达向量对流行病传播模型进行训练，将未知节点的表达向量输入训练好的流行病传播模型，获得流行病传播分析预测结果。其能够生成更高质量的节点表达，在基于社交网络的疫情传播分析领域能提供更好的应用支撑。