本发明提供了一种基于增强现实技术处理显微镜成像的方法，属于显微镜成像显示领域，该方法通过两个相机分别获取显微镜的左右目镜下目标显微成像的双路数字信号，将双路数字图像信号进行特征匹配后生成3D影像数据，对3D影像数据进行镜像处理后进行视差处理，并在对经过视差处理的3D影像数据应用slam算法进行影像空间定位后生成3D影像，并将3D影像投送至AR眼镜中显示；同时，通过建立指令数据库，根据输入控制指令调整3D影像的显示状态。该方法有效地取代了显微镜的镜像成像，使得操作手法更为简单，医生可以根据自身习惯及最舒适的状态，使用设备进行治疗，操作准确性更高，且能及时与患者沟通，保证医护双方更加舒适。