一种基于分子动力学的视紫红质光循环模拟方法
实质审查的生效
摘要
本发明请求保护一种分子动力学视紫红质蛋白光循环模拟研究方法，以单聚体进行模拟研究，属于神经科学领域和分子动力学领域。具体步骤如下：(1)使用高斯软件对发色团C12‑C13＝C14‑C15二面角进行扭转并进行角度调整；(2)将单聚体蛋白在CHARMM‑GUI软件嵌入细胞膜环境嵌入，对发色团小分子进行单独的力场设置(3)使用NAMD软件进行平衡态分子动力学模拟(4)对分子动力学轨迹进行分析，通过AMBER的cpptraj模块和VMD的tcl文件进行对应的分析。(5)使用拉伸分子动力学和伞形取样的方式计算自由能。该发明方法利用分子动力学研究视紫红质在光循环过程中的结构变化进一步实现光循环的仿真，对视紫红质在神经科学领域中的临床应用，脑功能研究以及工程学材料设计有着重要作用。
基本信息
专利标题 ：
一种基于分子动力学的视紫红质光循环模拟方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114530192A
申请号 ：
CN202210156563.4
公开（公告）日 ：
2022-05-24
申请日 ：
2022-02-21
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
袁帅刘春艳辛奇徐涛张文英
申请人 ：
重庆邮电大学
申请人地址 ：
重庆市南岸区南山街道崇文路2号
代理机构 ：
重庆市恒信知识产权代理有限公司
代理人 ：
刘小红
优先权 ：
CN202210156563.4
主分类号 ：
G16B5/00
IPC分类号 ：
G16B5/00 G06F30/20 G06F30/25 G06F119/14
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B5/00
特别适用于生物系统的建模或仿真，例如遗传基因管理网络、蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络的ICT
法律状态
2022-06-10 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 5/00
申请日 : 20220221
申请日 : 20220221
2022-05-24 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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