本申请涉及一种基于材料结构模拟的分子动力学势函数的评估方法。所述方法包括：S1、接收势函数和结构信息；S2、根据结构信息获得原胞结构，分析出弹性系数、点缺陷和表面结构的个数；S3、根据原胞结构生成超胞结构；S4、根据势函数信息生成作业输入文件，提交计算作业获得超胞结构弛豫后的性质；S5、用超胞结构构造出至少两个变形子结构，提交计算作业获得弛豫能量值，计算出弹性系数；S6、用超胞结构构建出相应的点缺陷结构，提交计算作业获得弛豫能量值，计算点缺陷形成能；S7、用超胞结构构建出相应的表面结构，提交计算作业获得弛豫能量值，计算表面形成能。本申请可以使用任意材料结构对任意势函数进行快速有效的评估。