本发明公开了一种多微网综合能源系统优化调度方法和系统，在第一阶段建立基于分时电价的电负荷需求响应模型，利用改进仿电磁学算法求最优解，求解后得到最优的电负荷功率和分时电价，然后将最优的电负荷功率和分时电价代入第二阶段建立的电‑热负荷响应结合的微电网优化调度模型，利用改进仿电磁学算法求最优解，得到最优解对应的综合能源调度策略。解决了现有的综合能源系统的能源调度，将电热网络的需求侧响应分开分析，难以实现在保持多微网功率平衡的情况下的综合能源最优调度，难以降低弃风弃光率，且受电热负荷和电价波动性的影响较大，鲁棒性低的技术问题。