本发明公开了一种多维点云结构相似性定量化评价方法及系统，所述方法包括：步骤1)获取目标物体的一幅三维点云图，得到三维点云数据；步骤2)对三维点云数据进行滤波处理；步骤3)将滤波后的点云数据以及滤波前的点云数据分别与采用置信度方法预先确定的标准三维点云集进行对比，分别得到滤波处理的三维结构相似性以及滤波前的三维结构相似性；步骤4)比较步骤3)得到的两种三维结构相似性，评价三维点云数据的滤波效果。本发明利用结构相似性方法对点云数据的滤波、稀疏效果进行客观、定量化的评价，解决了三维点云滤波没有较好的客观评价的现状。