本发明公开了一种依渠建库而移储蓄水的系统及方法，对水库库址选择的要求不是太高，而且选择的地域比较宽广，可灵活建库；移储蓄水库可以排活灌水轮期，最大限度地解决长期以来固有的禾田需水期与灌水轮期不同步这个无法调和的矛盾；增强了主水库渠系的功能，更大地发挥了主水库渠系的引水及输水作用；灵活而高质量的提升灌水效益，移储蓄水库既能分散储水加大储备水量，又可集中放水适时给农田灌水，不受原来灌水轮期的限制而灵活浇灌农田；代储剩余水量而为主水库提供清淤之便利。有条件对主水库进行清淤时，将灌苗期主水库中的水移存于移储蓄水库中，以最大限度保证主水库的清淤时间，有效降低主库的清淤难度，而且使农田灌溉少受或不受影响。