本发明公开了一种基于定制公交的司机管理码的发码系统及其方法，系统包括：数据管理云平台、司机终端、随车终端和公交车显示屏；方法包括以下步骤：获取相关数据，生成司机管理码，并发送至相应的司机终端；司机终端对司机管理码进行解码，获取公交路线数据和司机出勤安排数据；随车终端扫描司机终端上的司机管理码，司机终端记录扫描司机管理码的时间节点以及完成扫描动作的司机终端相关联的司机信息，数据管理云平台对司机信息进行身份校验；随车终端获取公交路线数据，将公交路线数据在公交车上进行显示；并根据公交路线数据对乘客进行收费。本发明有效解决了现有技术中公交路线信息以及司机出勤安排更新不够自动化的问题。