本发明公开一种高速数据Rapidio自适应接口新型自适应验证方法，属于芯片验证领域。高速数据Rapidio接口控制端加载并解析高速数据协议，与物理编码层进行数据交互；物理编码层包括数据编码和CRC校验编码，将高速数据Rapidio接口控制端传输的数据进行编码和时钟同步，并将编码的数据和同步的时钟分别传输到数据转换模块和时钟转换模块；时钟转换模块和数据转换模块根据物理编码层与物理介质接入层的数据位宽比，进行数据位宽和时钟频率转换并传输至物理介质接入层；物理介质接入层将同步转换的数据与时钟进行数据串行化。本发明自适应的解决了高速数据Rapidio接口中控制器与物理媒体层IP在时钟与数据位宽不匹配及数据不对齐的问题。