基于脉间频率编码脉内线性调频的间歇采样干扰抑制方法，涉及雷达抗干扰领域。本发明是为了解决现有间歇采样干扰抑制方法可实施性差，以及针对经过频率调制的间歇采样干扰时抑制会失效的问题。本发明包括：获取最优脉间频率编码脉内线性调频信号的回波；对回波进行脉冲压缩；将脉冲压缩结果在快时间维进行相位补偿；将相位补偿结果在慢时间维超分辨处理获得真假目标多普勒频率；利用真假目标多普勒频率构建设计斜投影矩阵；利用斜投影矩阵将相位补偿结果在慢时间维滤波处理；对滤波处理结果进行逆相位补偿；将逆相位补偿结果在慢时间维进行多普勒处理获得回波距离多普勒谱；利用回波距离多普勒谱实现目标有效探测。本发明用于抑制间歇采样干扰。