本发明公开了一种飞行区行为路线的智能预设方法及系统，其中，所述方法包括：基于飞行区时空地图模型，获得飞行区标识属性信息；对第一行驶目标物进行信息分层，获得第一地图信息层级；根据第一地图信息层级对飞行区标识属性信息进行分析，获得目标行驶区域；基于目标行为信息，确定所述第一行驶目标物的目标路径起点坐标和目标路径终点坐标；将所述目标行驶区域、所述目标路径起点坐标和所述目标路径终点坐标输入路线调配模型中，获得第一路线预设结果；如果所述第一路线预设结果存在冲突因素，基于时间窗算法获得备选预设路线集。解决了现有技术存在对飞行区内运行的调度路线规划不够准确合理，导致影响飞行区管理效率的技术问题。