本发明涉及一种全自动冲孔数控机床及其控制方法，包括机架（1）和自动冲孔钻头，在机架（1）上设有能够移动的定位台（3），所述定位台（3）通过夹紧限位装置将冲孔工件（5）进行固定，还包括控制单元，所述控制单元控制驱动机构使得所述定位台（3）向自动冲孔钻头下方移动，并且在上述移动过程中所述夹紧限位装置将冲孔工件（5）依次进行夹紧和限位。本发明通过一个驱动装置使得冲孔工件的左右夹紧、上下限位以及水平移动同步进行，因而改变了传统人工操作的模式，大大节省了人力参与，并且能够使得夹紧、限位以及移动全自动实现，适用于高精度部件的加工，也可以达到智能制造的要求。