本发明公开了一种大脑皮层表面重建方法和可读存储介质，属于医学图像处理领域。该大脑皮层表面重建方法包括以下步骤：将医学影像图像进行数据预处理，以获得标准化图像；将该标准化图像输入分割模型中分割与灰质相邻的大脑解剖结构，以获得区分后的大脑解剖结构分割图像；将区分后的大脑解剖结构分割图像和该标准化图像输入表面水平集预测模型，获得大脑解剖结构与灰质之间的分界面的水平集表示图像；将大脑解剖结构与灰质之间的分界面的水平集表示图像输入拓扑修复模块和多边形网格表示重建模块，以获得大脑解剖结构与灰质之间的分界面的多边形网格表示。