一种基于高通量测序对TCR β进行定量的方法
公开
摘要
本发明公开了一种基于高通量测序对TCRβ进行定量的方法，包括如下步骤：使用Trizol裂解样本，在裂解样本中加入外参细胞裂解液；提取样本和外参细胞的总RNA；利用TCRβ的C端特异性引物进行反转录；在反转录产物中加入模板；使用一组优化了序列组成和使用浓度的多重PCR引物构建TCRβ的高通量测序文库，并进行测序；利用2轮外参数据对样本中的TCRβ进行定量。本发明通过加入外参细胞，可对样本的T细胞总数进行有效估计；通过使用优化了序列组成和使用浓度的多重PCR引物，可更好的减少多重引物相互之间的干扰和扩增偏倚；通过加入模板，可帮助TCR高通量测序数据的校正和标准化，最后获得精准而真实的TCRβ库分布。
基本信息
专利标题 ：
一种基于高通量测序对TCR β进行定量的方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114561454A
申请号 ：
CN202210222259.5
公开（公告）日 ：
2022-05-31
申请日 ：
2022-03-03
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
万瑛倪青山于海礼韩清娟邹丽云曾聪黄毅陈钢
申请人 ：
中国人民解放军陆军军医大学
申请人地址 ：
重庆市沙坪坝区高滩岩正街30号
代理机构 ：
上海光华专利事务所(普通合伙)
代理人 ：
石欢欢
优先权 ：
CN202210222259.5
主分类号 ：
C12Q1/6869
IPC分类号 ：
C12Q1/6869 G16B30/00
IPC结构图谱
C
C部——化学；冶金
C12
生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验，如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6869
测序方法
法律状态
2022-05-31 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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