本申请提供了一种木马病毒检测方法及装置、存储介质及电子设备，该方法包括，在运行容器的宿主机上预先安装客户端，客户端中预设扫描程序，从而在接收到目标病毒检测请求后，通过启动扫描程序，可以获取待检测容器镜像包括的各个文件的文件哈希信息，并将各个文件哈希信息发送至服务端，服务端基于各个文件哈希信息，通过预设的样本文件库，对待检测容器镜像进行木马病毒检测，得到检测结果，并在检测结果表征待检测容器镜像中存在木马病毒时，发出告警信息。可见，本本申请方案，实现了对容器镜像中的文件的扫描，并基于容器镜像包括的各个文件的文件哈希信息，进行木马病毒检测，从而提高了检测结果的准确性。