本发明公开了一种基于信息融合的多星编队分布式相对导航方法，步骤如下：各从星通过通信协商或近邻构建两组不同的测量构型；建立滤波相对运动状态方程与测距测角量测方程；对局部测量构型1使用CKF滤波进行状态估计；对局部测量构型2使用CKF进行时间更新，利用局部滤波器1的状态估计结果代替相应的状态预测值以进行测量更新；在主滤波器进行信息融合；若编队构型发生变化，重新构建测量构型，否则系统直接再次进入卡尔曼滤波状态。本发明通过引入分布式滤波结构，将传统的主星估计环节分解至多星联合解算，降低了滤波运算量及单点故障风险，同时通过信息融合保证了精度，使得相对导航系统兼具准确性、鲁棒性以及可拓展性。