本发明公开一种头部多模态CT图像配准方法、装置及放射治疗设备，头部多模态CT图像配准方法具体包括以下内容：获取头部的参考图像和头部的待配准图像，对图像预处理后，分别进行面部边缘提取，得到头部轮廓曲线，再对头部轮廓曲线进行定量分析，得到头部特征曲线，降噪光滑处理后，对两条光滑的头部特征曲线的每一点求导，第一个导数为零的点则为头部表面的额部，以该点为中心，上下左右各增加指定数量的像素，提取出两幅图像的额窦区域，以两幅图像额窦区域质心坐标为依据对两幅图像进行配准。本发明使用图像识别技术利用人体头颅本身的生物特征作为图像配准的依据，利用特征点的位置信息，进行空间位置矫正，降低摆位误差，实现精确治疗。