本发明公开了一种产山奈酚的功能菌群及其制备和应用，属于微生物发酵产山奈酚技术领域。本发明以马铃薯和葡萄糖为底物，并利用芽孢杆菌改变细胞膜通透性和根瘤菌的介导作用，与镰刀菌共发酵生产山奈酚。所述生产方法简单，生产成本低，对环境友好，同时高产多种其它黄酮类化合物。经过该方法生产山奈酚，镰刀菌的山奈酚产量显著提高。本发明解决了山奈酚生产过程中污染严重和成本高昂的问题，能够为消费者提供一种更天然、更可持续的替代品，促进生物发酵技术工业化发展，并可以实现山奈酚规模化生产。