本发明涉及无人机探测技术领域，公开了一种穿越机识别驱离方法、系统及存储介质，该方法采用FM解调方式针对识别到的频点进行解调得到解调结果，并采用目标解析方式解析解调结果以确定待驱离穿越机的位置，这样，通过FM解调与目标解析方式相结合的方式可以准确获取待驱离穿越机的位置。此外，本申请还基于确定的位置跟踪待驱离穿越机，可以进一步确认飞手的位置。在此基础上，采用软件无线电模块向穿越机的位置发射警告驱离信号，可以节省大量时间与金钱的投入，仅影响非法穿越机占用的频段，不会对正常设备造成影响，减少对电磁环境的污染。