一种病毒基因识别和宿主预测的方法与系统
实质审查的生效
摘要
本发明公开了一种病毒基因识别方法,包括:获取待测样本的宏基因组;获取预处理的宏基因组的k‑mer频度向量;构建三元组并输入到第一三元组网络进行训练,训练后的第一三元组网络使病毒与细菌的特征向量距离增大;将宏基因组的k‑mer频度向量输入训练好的第一三元组网络,从中识别出病毒序列。本发明还公开了一种宿主预测的方法,包括:获取病毒序列;获取病毒序列的k‑mer频度向量;构建三元组并输入到第二三元组网络进行训练,训练后的第二三元组网络使病毒与宿主细菌的特征向量距离减小,病毒与非宿主细菌的特征向量距离增大;将病毒序列的k‑mer频度向量输入第二三元组网络,从而匹配出病毒可能的宿主细菌。
基本信息
专利标题 :
一种病毒基因识别和宿主预测的方法与系统
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN114512182A
申请号 :
CN202210291560.1
公开(公告)日 :
2022-05-17
申请日 :
2022-03-23
授权号 :
暂无
授权日 :
暂无
发明人 :
王颖杨孜孜
申请人 :
厦门大学
申请人地址 :
福建省厦门市思明区思明南路422号
代理机构 :
厦门福贝知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人 :
陈远洋
优先权 :
CN202210291560.1
主分类号 :
G16B20/00
IPC分类号 :
G16B20/00 G16B40/00
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学,例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B20/00
特别适用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如基因型-表型关联的ICT
法律状态
2022-06-03 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 20/00
申请日 : 20220323
申请日 : 20220323
2022-05-17 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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