本发明提供一种中药处方分析方法、系统及计算机设备，该方法包括：基于历史数据集构建病种与对应的四诊信息之间的第一对应关系、药方与对应的药材之间的第二对应关系，对历史数据集中四诊信息和药材的中药学表现性征按照预设基础指标体系中的基础指标进行表示；对已有目标药方的目标病种，根据第一对应关系获取目标病种对应的四诊信息，根据四诊信息的基础指标表示建立目标病种的数学表示模型；根据第二对应关系获取目标药方对应药材，根据药材的基础指标表示建立目标药方的数学表示模型；根据目标病种的数学表示模型与目标药方的数学表示模型的对等关系对目标药方正确性进行判别。本发明能够科学有效的实现药方分析，为中医药体系提供有力支撑。