本发明提供了一种有机硅改性聚氨酯材料及其制备方法和应用，涉及聚氨酯材料技术领域。本发明提供的有机硅改性聚氨酯材料的制备方法，包括以下步骤：将异氰酸酯封端聚醚低聚物、异氰酸酯封端硅树脂低聚物和极性溶剂混合，脱气后得到混合低聚物；将所述混合低聚物和胺类固化剂以及催化剂混合，依次进行固化和熟化，得到有机硅改性聚氨酯材料。本发明采用异氰酸酯封端聚醚低聚物和异氰酸酯封端硅树脂低聚物进行共聚改性，提高聚氨酯的自润滑及耐磨性能；利用胺类固化剂制备聚氨酯，由于脲基的存在，使其具有较高的力学性能。采用本发明制备的有机硅改性聚氨酯材料在320齿轮油中具有极高的稳定性，在水中耐高温可达80℃。