本发明涉及轨道交通车厢接驳技术领域，具体为一种轨道交通工具自动接驳交换车厢结构及其接驳方法，包括车站轨道结构、接驳交换车厢结构和自动对接交换系统，所述车站轨道结构包括主车轨道和接驳车站轨道，所述接驳交换车厢结构包括母车车厢和子车，所述主车轨道和接驳车站轨道之间相互平行，高度一致，所述母车车厢的内部设置有一号车位和二号车位。本发明，通过设置该车站轨道结构、接驳交换车厢结构和自动对接交换系统，在母车车厢和子车等结构的相互配合下，可以在轨道交通工具不用进站停车就可以在高速运行状态下完成上下旅客或者上下货物的目的，可以省去进站停车所需时间，大幅提高了整个轨道系统的运行效率。