本发明提供了一种水域测绘数据采集装置，包括船体，所述船体连接有水下数据的水下数据检测单元，所述船体上表面连接有两个保护罩，两个所述保护罩上表面固定连接有太阳能板，所述船体放置有无人机，所述船体开设有机脚容纳孔，所述机脚容纳孔连接有卡接组件和充电组件，所述无人机下表面固定连接有水上数据检测单元，所述水上数据检测单元位于无人机下表面中心位置。保护罩在运输时可以到保护无人机，太阳能板能够在有光照的情况下持续进行充电，无人机降落时，只需引导锥头落入机脚容纳孔范围内即可通过锥度自动找正降落位置，大大降低了因船体晃动而引起的降落难度。