本公开涉及一种流域尺度WEFE系统适配性模拟优化方法，所述方法包括构建WEFE系统安全风险综合评价模型；采集待研究区域的指标数值作为输入数据，并采用安全风险评估模型评估待研究区域的安全风险，获得待研究区域的风险等级；构建干支流水资源调配耦合模型，将风险等级作为干支流水资源调配耦合模型的判定条件，以已采集的研究区域各场景的干支流径流数据、水利工程特征参数和用水终端的用水数据作为干支流水资源调配耦合模型的输入，计算获得不同场景的优化调度方案集。本公开能够大大加快模拟优化的速度，提高模拟的精度和适配性，可以有效提升水资源利用效率，有利于促进水电的绿色发展。