本申请公开一种电机同步控制方法、系统、车辆及存储介质，涉及电机控制技术领域，能够通过提高双三相冗余电机的同步控制精度，来降低车辆的方向盘的转矩脉动，具体方案包括：主控制器生成第一周期的第一同步信号；主控制器将第一同步信号发送至从控制器，并根据第一同步信号生成主控制信号，以及生成主控制信号对应的第二同步信号，且利用主控制信号控制主电机在第一周期内运转；其中，第二同步信号用于第二周期内的主电机和从电机的同步，第二周期为第一周期的下一周期，第二周期为主控制信号的周期；从控制器根据第一同步信号生成从控制信号，并利用从控制信号控制从电机在第一周期内运转。