本发明提供了一种水解胶原蛋白及其制备方法和应用。水解胶原蛋白制备方法包括：S1：对牛皮进行预处理，得到预处理牛皮；S2：对预处理牛皮进行匀浆消化，得到匀浆消化液；其中，匀浆消化包括匀浆处理和采用胃蛋白酶进行的消化处理；S3：对匀浆消化液进行吸附过滤，得到吸附过滤液；S4：对至少部分吸附过滤液依次进行浓缩换液、离子交换层析、二次浓缩换液、过滤除菌、离心精制，得到胶原蛋白；S5：收集步骤S1‑S4的废液，以收集的废液和/或另一部分吸附过滤液作为水解前液，对水解前液进行酸水解，得到水解胶原蛋白。本发明能够同时制备水解胶原蛋白和胶原蛋白，水解胶原蛋白的分子量均一性好，胶原蛋白的收率和纯度高，产品质量优异。