本发明涉及关联度延拓Hibert移相电子式互感器校验仪溯源方法和系统，以标准功率源电压输出两路相同的模拟信号和比较信号，模拟信号输出至电子式互感器校验仪的模拟输入端口，比较信号经标准A/D及协议转换后的数字标准信号发送至数字输入端口；对所述比较信号经过标准A/D采样后的数字采样信号进行时序加权关联度波形匹配端点延拓，并对延拓数据加Nuttall窗，进而进行希尔伯特变换移相，以确定相位微差；基于微差信号与电子式互感器校验仪的示值误差确定电子式互感器校验仪的测量误差。本发明以希尔伯特变换移相为前提，以信号源的特点为依据，提出了时序加权关联度波形匹配端点延拓和Nuttall窗函数结合的方法，克服端点效应，以此提高相位微差的添加精度。